MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 83774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019703	CAG	2	6	8	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
2	NC_019703	CTT	2	6	31	36	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223462
3	NC_019703	GCTACA	2	12	57	68	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428223462
4	NC_019703	GCC	2	6	74	79	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
5	NC_019703	CG	3	6	162	167	0 %	0 %	50 %	50 %	428223462
6	NC_019703	CAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223462
7	NC_019703	CGCCAG	2	12	270	281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428223462
8	NC_019703	CGA	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
9	NC_019703	GCC	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
10	NC_019703	CCG	3	9	337	345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
11	NC_019703	TCG	3	9	410	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223462
12	NC_019703	CAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
13	NC_019703	CGC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
14	NC_019703	CGGG	2	8	471	478	0 %	0 %	75 %	25 %	428223462
15	NC_019703	GCG	3	9	500	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223462
16	NC_019703	CGC	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
17	NC_019703	CCG	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
18	NC_019703	CTG	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223462
19	NC_019703	CGA	2	6	690	695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
20	NC_019703	AGT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223462
21	NC_019703	GACC	2	8	793	800	25 %	0 %	25 %	50 %	428223462
22	NC_019703	AGA	2	6	908	913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
23	NC_019703	GCCT	2	8	935	942	0 %	25 %	25 %	50 %	428223462
24	NC_019703	ACA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
25	NC_019703	AAG	3	9	1087	1095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
26	NC_019703	GCC	2	6	1132	1137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
27	NC_019703	GC	3	6	1198	1203	0 %	0 %	50 %	50 %	428223462
28	NC_019703	AC	3	6	1230	1235	50 %	0 %	0 %	50 %	428223462
29	NC_019703	GAGCT	2	10	1237	1246	20 %	20 %	40 %	20 %	428223462
30	NC_019703	GAA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
31	NC_019703	GGC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223462
32	NC_019703	ACG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
33	NC_019703	AAC	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
34	NC_019703	CTT	2	6	3010	3015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223463
35	NC_019703	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223463
36	NC_019703	CTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223463
37	NC_019703	GC	3	6	3087	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	428223463
38	NC_019703	ATG	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223463
39	NC_019703	TTG	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223464
40	NC_019703	AAG	2	6	3619	3624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223464
41	NC_019703	CGC	2	6	3758	3763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223464
42	NC_019703	CGG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223464
43	NC_019703	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223464
44	NC_019703	CCAAG	2	10	3938	3947	40 %	0 %	20 %	40 %	428223464
45	NC_019703	ACG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
46	NC_019703	ACG	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
47	NC_019703	CTGC	2	8	4129	4136	0 %	25 %	25 %	50 %	428223464
48	NC_019703	TGG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223464
49	NC_019703	TCA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223464
50	NC_019703	CAT	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223464
51	NC_019703	GCT	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223464
52	NC_019703	CGT	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223464
53	NC_019703	GAC	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
54	NC_019703	TCAA	2	8	4563	4570	50 %	25 %	0 %	25 %	428223465
55	NC_019703	CAC	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223465
56	NC_019703	AAT	2	6	4649	4654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223465
57	NC_019703	TCAA	2	8	4767	4774	50 %	25 %	0 %	25 %	428223465
58	NC_019703	TGG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223465
59	NC_019703	CTG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223466
60	NC_019703	AGCA	2	8	5111	5118	50 %	0 %	25 %	25 %	428223466
61	NC_019703	GTTG	2	8	5148	5155	0 %	50 %	50 %	0 %	428223466
62	NC_019703	CAT	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223466
63	NC_019703	CGG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
64	NC_019703	GGC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
65	NC_019703	CAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223467
66	NC_019703	AAG	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223467
67	NC_019703	CTA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223467
68	NC_019703	CGG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
69	NC_019703	ATCG	2	8	5740	5747	25 %	25 %	25 %	25 %	428223467
70	NC_019703	AGC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
71	NC_019703	GCT	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
72	NC_019703	AGC	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
73	NC_019703	GCA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
74	NC_019703	GCT	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
75	NC_019703	CTG	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
76	NC_019703	CGT	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
77	NC_019703	CAC	3	9	6177	6185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
78	NC_019703	GGC	2	6	6214	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
79	NC_019703	AGC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
80	NC_019703	GGC	2	6	6396	6401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
81	NC_019703	GC	3	6	6400	6405	0 %	0 %	50 %	50 %	428223467
82	NC_019703	CGG	2	6	6435	6440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
83	NC_019703	ACC	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
84	NC_019703	TGG	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223467
85	NC_019703	CAA	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223467
86	NC_019703	ACC	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
87	NC_019703	GAC	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
88	NC_019703	CAT	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223467
89	NC_019703	CTG	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
90	NC_019703	GCC	2	6	6707	6712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223467
91	NC_019703	CCTCA	2	10	6751	6760	20 %	20 %	0 %	60 %	428223467
92	NC_019703	TGCC	2	8	6770	6777	0 %	25 %	25 %	50 %	428223467
93	NC_019703	ATC	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223468
94	NC_019703	TCG	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
95	NC_019703	AGG	2	6	7186	7191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223468
96	NC_019703	G	6	6	7225	7230	0 %	0 %	100 %	0 %	428223468
97	NC_019703	T	7	7	7239	7245	0 %	100 %	0 %	0 %	428223468
98	NC_019703	TGG	2	6	7274	7279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
99	NC_019703	G	6	6	7282	7287	0 %	0 %	100 %	0 %	428223468
100	NC_019703	CCAA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	0 %	50 %	428223468
101	NC_019703	GAT	2	6	7373	7378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223468
102	NC_019703	GGC	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
103	NC_019703	TGT	2	6	7488	7493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223468
104	NC_019703	TGG	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
105	NC_019703	GGC	2	6	7585	7590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
106	NC_019703	GT	3	6	7628	7633	0 %	50 %	50 %	0 %	428223468
107	NC_019703	AGCC	2	8	7643	7650	25 %	0 %	25 %	50 %	428223468
108	NC_019703	CGC	2	6	7651	7656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223468
109	NC_019703	TGG	2	6	7662	7667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223468
110	NC_019703	CGG	2	6	7681	7686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223468
111	NC_019703	CGT	2	6	7783	7788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
112	NC_019703	GAC	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223468
113	NC_019703	TGC	3	9	7821	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223468
114	NC_019703	CAGG	2	8	7946	7953	25 %	0 %	50 %	25 %	428223468
115	NC_019703	GCTAT	2	10	8049	8058	20 %	40 %	20 %	20 %	428223468
116	NC_019703	AATG	2	8	8194	8201	50 %	25 %	25 %	0 %	428223469
117	NC_019703	CTG	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
118	NC_019703	GCA	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
119	NC_019703	GCA	2	6	8278	8283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
120	NC_019703	ACT	2	6	8307	8312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223469
121	NC_019703	GGT	2	6	8320	8325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223469
122	NC_019703	GACC	2	8	8409	8416	25 %	0 %	25 %	50 %	428223469
123	NC_019703	CGA	2	6	8419	8424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
124	NC_019703	T	6	6	8450	8455	0 %	100 %	0 %	0 %	428223469
125	NC_019703	CGG	2	6	8513	8518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
126	NC_019703	GCAA	2	8	8544	8551	50 %	0 %	25 %	25 %	428223469
127	NC_019703	ATG	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223469
128	NC_019703	TGC	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
129	NC_019703	GCC	2	6	8810	8815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223469
130	NC_019703	GCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
131	NC_019703	ACT	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223469
132	NC_019703	GAT	2	6	8963	8968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223469
133	NC_019703	GGC	2	6	8977	8982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
134	NC_019703	GGT	2	6	8983	8988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223469
135	NC_019703	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
136	NC_019703	GCG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
137	NC_019703	GGC	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223469
138	NC_019703	GGA	2	6	9157	9162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223469
139	NC_019703	TGAG	2	8	9183	9190	25 %	25 %	50 %	0 %	428223469
140	NC_019703	CAG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223469
141	NC_019703	GC	3	6	9216	9221	0 %	0 %	50 %	50 %	428223469
142	NC_019703	CAC	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223469
143	NC_019703	GGCC	2	8	9322	9329	0 %	0 %	50 %	50 %	428223469
144	NC_019703	TGC	2	6	9423	9428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223469
145	NC_019703	ATT	2	6	9436	9441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223469
146	NC_019703	ATTCCG	2	12	9694	9705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428223470
147	NC_019703	CGG	2	6	9718	9723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223470
148	NC_019703	GAA	2	6	9871	9876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223471
149	NC_019703	CAT	2	6	9967	9972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223471
150	NC_019703	CGA	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223472
151	NC_019703	GTGG	2	8	10426	10433	0 %	25 %	75 %	0 %	428223472
152	NC_019703	GGC	2	6	10492	10497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223472
153	NC_019703	AAG	2	6	10572	10577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223472
154	NC_019703	GCG	2	6	10615	10620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223472
155	NC_019703	TCT	2	6	10702	10707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223472
156	NC_019703	GCT	2	6	10714	10719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223472
157	NC_019703	CTG	2	6	10763	10768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223472
158	NC_019703	ACG	2	6	10862	10867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223472
159	NC_019703	GCC	2	6	10910	10915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223472
160	NC_019703	ATCA	2	8	11173	11180	50 %	25 %	0 %	25 %	428223473
161	NC_019703	GC	3	6	11369	11374	0 %	0 %	50 %	50 %	428223474
162	NC_019703	GCAGCG	2	12	11417	11428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	428223474
163	NC_019703	CAG	2	6	11519	11524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223474
164	NC_019703	G	7	7	11526	11532	0 %	0 %	100 %	0 %	428223474
165	NC_019703	GCG	2	6	11556	11561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223474
166	NC_019703	CGG	2	6	11574	11579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223474
167	NC_019703	CTA	2	6	11581	11586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223474
168	NC_019703	GCTCGG	2	12	11653	11664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428223474
169	NC_019703	GAT	2	6	11716	11721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223474
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171	NC_019703	CCAGC	2	10	11782	11791	20 %	0 %	20 %	60 %	428223474
172	NC_019703	GCG	2	6	11793	11798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223474
173	NC_019703	TGC	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223474
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248	NC_019703	GCG	2	6	15799	15804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223479
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250	NC_019703	GCG	2	6	15833	15838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223479
251	NC_019703	AAG	2	6	16167	16172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223480
252	NC_019703	TTGA	2	8	16196	16203	25 %	50 %	25 %	0 %	428223480
253	NC_019703	CGG	2	6	16257	16262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223480
254	NC_019703	TGC	2	6	16284	16289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
255	NC_019703	GGGCT	2	10	16292	16301	0 %	20 %	60 %	20 %	428223480
256	NC_019703	CTG	2	6	16307	16312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
257	NC_019703	GGC	2	6	16336	16341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223480
258	NC_019703	TCA	2	6	16374	16379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223480
259	NC_019703	GCG	2	6	16456	16461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223480
260	NC_019703	CTG	2	6	16475	16480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
261	NC_019703	CCGGC	2	10	16542	16551	0 %	0 %	40 %	60 %	428223480
262	NC_019703	CTGC	2	8	16600	16607	0 %	25 %	25 %	50 %	428223480
263	NC_019703	CTG	2	6	16637	16642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
264	NC_019703	TGG	2	6	16658	16663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223480
265	NC_019703	CTT	2	6	16666	16671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223480
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267	NC_019703	GCG	2	6	16733	16738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223480
268	NC_019703	CTG	2	6	16739	16744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
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271	NC_019703	GTG	2	6	16855	16860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223480
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275	NC_019703	CCG	2	6	16977	16982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223480
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279	NC_019703	ACT	2	6	17097	17102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223480
280	NC_019703	GCT	2	6	17176	17181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
281	NC_019703	GCT	2	6	17185	17190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
282	NC_019703	CAG	2	6	17254	17259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223480
283	NC_019703	CTG	2	6	17297	17302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
284	NC_019703	CTT	2	6	17341	17346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223480
285	NC_019703	TGC	2	6	17355	17360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223480
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288	NC_019703	TGTGC	2	10	17509	17518	0 %	40 %	40 %	20 %	428223480
289	NC_019703	CAT	2	6	17527	17532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223480
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292	NC_019703	GAC	2	6	17634	17639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223480
293	NC_019703	CCG	2	6	17651	17656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223481
294	NC_019703	AAC	2	6	17658	17663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223481
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298	NC_019703	C	7	7	17982	17988	0 %	0 %	0 %	100 %	428223481
299	NC_019703	GGC	2	6	18036	18041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223481
300	NC_019703	ACA	2	6	18068	18073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223481
301	NC_019703	CTA	2	6	18102	18107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223481
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377	NC_019703	GAA	2	6	21823	21828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223485
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381	NC_019703	TCAG	2	8	22220	22227	25 %	25 %	25 %	25 %	428223485
382	NC_019703	GGC	2	6	22239	22244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223485
383	NC_019703	GGC	2	6	22411	22416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223486
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